沉井施工时，需先将场地平整，在基坑上展设必定厚度的砂层，在刃脚地位再展设垫木。然后再垫木上制造刃脚和节沉井。当沉井缓凝强度达70%时，才可拆除垫木，挖土下沉。为进步混凝土沉井的防水性能，减少沉井下沉时的摩擦阻力，好在混凝土沉井拆模后，在沉井的外壁做防水砂浆抹面。当沉井降落到设计标高后，沉井地面用混凝土封底，以防地下水渗透井内。当沉井仅作为穿过地表含水层在不透水层中构筑隧道出入口时，可不用封底，但须封住地下水下渗的途径。
采用泥浆润滑套法即在井壁周围空隙中充填触变性较大的泥浆(膨润土20％、火碱5％、水75％)或黄泥浆，使其形成一个具有润滑作用的泥浆套，可以大大减少作用在井壁上摩阻力，并加强管理，防止泥浆流失。对松软土质，可先挖沉井中部土层(每层约深40～50cm)，沿沉井刃脚周围保留土堤，使沉井挤土下沉；对中等密实的土，如刃脚土堤挖出后仍很少下沉，可再从中部向刃脚分层均匀削薄土堤，使沉井平稳下沉。实际上在挖土下沉时不可能是竖直均匀下沉，每沉一次，难免有些倾斜，继续挖土时，可在井体倾斜的反方向一边增大挖土量。
在刃脚遇到障碍物的情况下，必须先清除后再下沉。清除方法是人工排除，在不能排水的情况下，由洁水工进行下切割或者水下。引起沉井偏斜的原因，可能是沉井在制作时，就出现歪斜或挖土出现不均匀或地层土质软硬不均匀或井外侧临时堆土不当或沉井底部的一部分遇到障碍物等，都会引起沉井偏斜。导管不能进水。混凝土面的终灌注高度，应比设计值高出150mm以上，待混凝土达到设计要求后，再抽水，凿除表面松弱层。